Palestinian Airlines được thành lập ngày 1.1.1995 và bắt đầu hoạt động từ tháng 6/1997 bằng một loạt chuyến bay thuê bao chở các người Hồi giáo hành hương tới Jeddah từ căn cứ của hãng ở Gaza, nhưng sau đó bị Israel cấm, nên dời về Port Said, bắc Ai Cập. Ngày 23.7.1997, hãng bắt đầu mở các tuyến đường thường xuyên từ El Arish tới Jordan và Ả Rập Xê Út. Tháng 11/1998 Palestinian Airlines lại chuyển về sân bay mới mở ở Gaza. Tháng 10/2000, hãng tạm ngưng hoạt động vì bắt đầu có cuộc nổi dậy của người Palestine chống lại Israel (Al-Aqsa Intifada) và tháng 12/2001 buộc phải chuyển căn cứ về Sân bay quốc tế El Arish, sau khi phi đạo của Sân bay quốc tế Yasser Arafat bị phá hủy. Hãng hiện do chính phủ Palestine làm chủ và có 398 nhân viên (tháng 3/2007).[1]